南京雨花石的价格因品质、尺寸、纹理及市场定位不同而差异显著，当前市场行情可大致分为以下梯度：
入门级雨花石（10-50元）：这类石头多为普通玛瑙质地，纹理简单，色彩以单色或双色为主，常出现在清凉山石市或老门东的流动摊位。它们多为开采后的边角料或简单抛光的原石，适合新手收藏或作为旅游纪念品。部分摊主表示，这类石头走量快，主要满足游客的初次体验需求。
精品级雨花石（200-2000元）：当雨花石出现草花、水波纹、云雾等典型纹理，或呈现山水、人物等意象时，价格显著提升。例如，一块直径3厘米的“红梅报春”石，因红色玛瑙中嵌入白色雪花纹，被藏家以1800元购入。这类石头多产自六合横梁等优质产区，需人工筛选与精细打磨，常作为文玩把件或茶席雅器。
收藏级雨花石（5000元至无上限）：顶级雨花石需满足“形、质、色、纹、韵”五绝标准，且尺寸超过5厘米的完整石料极为罕见。例如，一块名为“金陵十二钗”的雨花石曾以38万元成交，因其集合黄、红、黑三色玛瑙，纹理酷似十二位古装女子。这类藏品多通过拍卖行或私人交易流转，成为财富与品味的象征。
影响价格的核心因素包括：玛瑙质地（玉髓质价格是普通玛瑙的3-5倍）、矿物共生体（含蛋白石、水晶的“活石”极为稀有）、人文意象（如“嫦娥奔月”石因白色纹路形似仙子，拍出8.8万元）以及流通渠道（地摊与拍卖行的价格可能相差十倍）。
值得注意的是，2024年南京六合雨花石产业通过跨境电商实现3.5亿元年销售额，文创衍生品如蓝牙音箱小夜灯等成为海外市场宠儿。这一趋势表明，雨花石正从传统收藏向文化IP衍生品拓展，其市场价值已突破传统维度。
